Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hps4Q99KG7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms