Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lims1Q99JW4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lims1Q99JW4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lims1Q99JW4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lims1Q99JW4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lims1Q99JW4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lims1Q99JW4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lims1Q99JW4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lims1Q99JW4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lims1Q99JW4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lims1Q99JW4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lims1Q99JW4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms