Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnip2Q99JG7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms