Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Pacsin3Q99JB8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms