Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddb2Q99J79 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddb2Q99J79 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms