Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Thumpd1Q99J36 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms