Protein–RNA interactions for Protein: Q99J23

Ghdc, GH3 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhdcQ99J23 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GhdcQ99J23 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms