Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Lmo1Q924W9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmo1Q924W9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms