Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ripply3Q924S9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ripply3Q924S9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms