Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim7Q923T7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms