Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b5Q923D4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.2 ms