Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubxn1Q922Y1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn1Q922Y1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms