Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Afg3l1Q920A7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms