Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZM2

Sh2b1, SH2B adapter protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b1Q91ZM2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh2b1Q91ZM2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh2b1Q91ZM2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2b1Q91ZM2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms