Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf6Q91YR7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms