Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y17

Pcdha2, Protocadherin alpha 2, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha2Q91Y17 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha2Q91Y17 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha2Q91Y17 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha2Q91Y17 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha2Q91Y17 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha2Q91Y17 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha2Q91Y17 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha2Q91Y17 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha2Q91Y17 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha2Q91Y17 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha2Q91Y17 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha2Q91Y17 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdha2Q91Y17 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha2Q91Y17 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha2Q91Y17 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha2Q91Y17 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha2Q91Y17 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha2Q91Y17 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha2Q91Y17 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha2Q91Y17 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha2Q91Y17 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.1 ms