Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG6

Traip, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraipQ8VIG6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TraipQ8VIG6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms