Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf4Q8VI88 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf4Q8VI88 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms