Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mark1Q8VHJ5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mark1Q8VHJ5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mark1Q8VHJ5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mark1Q8VHJ5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mark1Q8VHJ5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mark1Q8VHJ5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mark1Q8VHJ5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mark1Q8VHJ5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mark1Q8VHJ5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mark1Q8VHJ5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mark1Q8VHJ5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mark1Q8VHJ5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mark1Q8VHJ5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mark1Q8VHJ5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mark1Q8VHJ5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms