Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt79Q8VED5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt79Q8VED5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms