Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD6

Reep2, Receptor expression-enhancing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep2Q8VCD6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Reep2Q8VCD6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Reep2Q8VCD6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Reep2Q8VCD6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms