Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc9Q8VC31 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms