Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5C8

Zmynd11, Zinc finger MYND domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmynd11Q8R5C8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zmynd11Q8R5C8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zmynd11Q8R5C8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms