Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nup35Q8R4R6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms