Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gga1Q8R0H9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga1Q8R0H9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga1Q8R0H9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms