Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssh3Q8K330 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms