Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc12Q8K2L8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc12Q8K2L8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc12Q8K2L8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc12Q8K2L8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc12Q8K2L8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc12Q8K2L8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc12Q8K2L8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc12Q8K2L8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trappc12Q8K2L8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms