Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mtmr3Q8K296 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mtmr3Q8K296 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mtmr3Q8K296 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mtmr3Q8K296 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mtmr3Q8K296 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mtmr3Q8K296 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mtmr3Q8K296 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mtmr3Q8K296 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mtmr3Q8K296 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mtmr3Q8K296 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms