Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms