Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syne4Q8CII8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syne4Q8CII8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms