Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI43

Myl6b, Myosin light chain 6B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl6bQ8CI43 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Myl6bQ8CI43 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myl6bQ8CI43 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myl6bQ8CI43 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myl6bQ8CI43 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myl6bQ8CI43 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myl6bQ8CI43 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myl6bQ8CI43 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myl6bQ8CI43 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms