Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rftn2Q8CHX7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rftn2Q8CHX7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms