Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc17Q8CE13 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms