Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc38Q8CDN8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms