Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Riox2Q8CD15 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms