Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB96

Rassf4, Ras association domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf4Q8CB96 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rassf4Q8CB96 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rassf4Q8CB96 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rassf4Q8CB96 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rassf4Q8CB96 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rassf4Q8CB96 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rassf4Q8CB96 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rassf4Q8CB96 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rassf4Q8CB96 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rassf4Q8CB96 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rassf4Q8CB96 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rassf4Q8CB96 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rassf4Q8CB96 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rassf4Q8CB96 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rassf4Q8CB96 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rassf4Q8CB96 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rassf4Q8CB96 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rassf4Q8CB96 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rassf4Q8CB96 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rassf4Q8CB96 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms