Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc5Q8CAL5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc5Q8CAL5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms