Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfibp1Q8C8U0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 332.2 ms