Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vwc2Q8C8N3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vwc2Q8C8N3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms