Protein–RNA interactions for Protein: Q8C804

Spice1, Spindle and centriole-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spice1Q8C804 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spice1Q8C804 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spice1Q8C804 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spice1Q8C804 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spice1Q8C804 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spice1Q8C804 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spice1Q8C804 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spice1Q8C804 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spice1Q8C804 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spice1Q8C804 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spice1Q8C804 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spice1Q8C804 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spice1Q8C804 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spice1Q8C804 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spice1Q8C804 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spice1Q8C804 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spice1Q8C804 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spice1Q8C804 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spice1Q8C804 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spice1Q8C804 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spice1Q8C804 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms