Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933409G03RikQ8C5U0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933409G03RikQ8C5U0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms