Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8C5C9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8C5C9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8C5C9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8C5C9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8C5C9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8C5C9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8C5C9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C5C9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8C5C9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8C5C9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms