Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc60Q8C4J0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc60Q8C4J0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc60Q8C4J0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc60Q8C4J0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc60Q8C4J0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc60Q8C4J0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc60Q8C4J0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc60Q8C4J0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc60Q8C4J0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc60Q8C4J0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc60Q8C4J0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc60Q8C4J0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc60Q8C4J0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc60Q8C4J0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc60Q8C4J0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc60Q8C4J0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc60Q8C4J0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc60Q8C4J0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms