Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg16l1Q8C0J2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg16l1Q8C0J2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms