Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Usp47Q8BY87 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Usp47Q8BY87 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp47Q8BY87 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp47Q8BY87 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp47Q8BY87 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp47Q8BY87 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp47Q8BY87 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp47Q8BY87 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp47Q8BY87 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp47Q8BY87 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Usp47Q8BY87 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Usp47Q8BY87 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp47Q8BY87 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Usp47Q8BY87 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms