Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY02

Nkrf, NF-kappa-B-repressing factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkrfQ8BY02 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NkrfQ8BY02 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NkrfQ8BY02 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NkrfQ8BY02 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NkrfQ8BY02 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NkrfQ8BY02 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NkrfQ8BY02 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NkrfQ8BY02 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NkrfQ8BY02 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NkrfQ8BY02 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NkrfQ8BY02 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NkrfQ8BY02 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NkrfQ8BY02 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NkrfQ8BY02 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms