Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXZ0

Ctxn3, Cortexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn3Q8BXZ0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctxn3Q8BXZ0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctxn3Q8BXZ0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms