Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc169Q8BXX9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc169Q8BXX9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms