Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp5Q8BX09 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms