Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TtpaQ8BWP5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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